Объединение трех ведомств опирается на общие принципы государственной реформы: сократить число учреждений и дублирование, повысить качество и доступность публичных услуг. Новое ведомство должно стать центром компетенции в сфере транспорта. Его задача - планирование наиболее эффективных логистических решений и выполнение крупномасштабных проектов, затрагивающих разные виды транспорта. Согласно пояснительной записке, объединение департаментов позволит улучшить конкурентоспособность Эстонии на международном уровне, повысить эффективность защиты окружающей среды и оказать более активную поддержку экономическому развитию государства.

Реорганизация затронет не только сотрудничество между департаментами. При объединении в Министерстве экономики и коммуникаций будет создана должность вице-канцлера по вопросам мореходства. Это создаст возможности более целостного развития морской экономики; проект по привлечению судов под эстонский флаг также будет рассматриваться на высшем уровне.

Ведомства будут объединены 1 января 2021 года. К моменту вступления закона в силу будут завершены действия, сопряженные со слиянием департаментов, в том числе разработка устава, структуры и деятельность, связанная с персоналом нового департамента. Будут решены вопросы, связанные с бюджетом. Кроме того, в связи с изменением законов необходимые правки начнут вноситься в опирающиеся на эти законы постановления. Вопросы, касающиеся персонала, будут решаться в каждом учреждении отдельно.

Проект Закона об изменении Закона о правительстве республики и других законов (объединение Авиацинного департамента, Департамента шоссейных дорог и Департамента водных путей) был инициирован правительством.