Maksuhaldur registreerib maksumaksjate ühise taotluse alusel ja KMS § 26 lg 1 toodud tingimuste olemasolul (näiteks emaettevõtja ja tütarettevõtjad äriseadustiku tähenduses või samale isikule kuulub vähemalt 50 % ühe maksukohustuslasena registreerimist taotlevate isikute aktsiatest) maksukohustuslased ühe maksukohustuslasena.

Ühe maksukohustuslasena registreerimise kord, registreerimisavalduse vorm ning maksukohustuslaste taotlusel nende ühe maksukohustuslasena registreerimise otsuse kehtetuks tunnistamise kord on kehtestatud rahandusministri 07.04.04 määrusega nr 71. Kui ühe maksukohustuslasena soovivad registreeruda maksukohustuslasena registreerimata isikud, siis registreerib maksuhaldur nad eelnevalt eraldi maksukohustuslasteks (KMS § 26 lg 2).

Siinkohal juhime tähelepanu asjaolule, et ühe maksukohustuslasena registreeritud isikud esitavad küll käibedeklaratsioonid eraldi, kuid vastutavad käibemaksu tähtaegse tasumise eest solidaarselt. Kui näiteks ühe maksukohustuslasena registreeritutest tekib ühel isikul mõnel maksustamisperioodil käibemaksu enammakse ja teine isik jätab mõne tasumisele kuuluv käibemaksusumma tasumata, kaetakse võlguolev käibemaksusumma esimese (ühe maksukohustuslasena registreeritud) isiku enammakse arvelt. Seda ka tagasiulatuvalt, st peale ühe maksukohustuslasena registreerimise otsuse kehtetuks tunnistamist, perioodi osas, mil oldi ühe maksukohustuslasena registreeritud.

Ühe maksukohustuslasena registreerimise otsus tunnistatakse kehtetuks järgmistel juhtudel (KMS § 26 lg 3):

- KMS § 26 lõikes 1 nimetatud asjaolude äralangemine
- ühe maksukohustuslasena registreeritud maksukohustuslaste ühine taotlus.
Üksiku (ühe maksukohustuslasena registreeritud) isiku tahteavaldus eraldi KMS kohaselt ühe maksukohustuslasena registreerimise otsuse kehtetuks tunnistamise aluseks ei ole.